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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一只身为纸业原材料而被熟悉的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“产生有害垃圾”当上“遗迹小原子”的心酸路程类似,到最近近二十一两年才被感觉其非常重要的生物体学效果,从次“侧睡农奴把独唱”,尤其是在免役发炎性症状实验范围内熠熠生辉。至今好几篇文有关资料了在很多发炎性症状的节肢动物建模方法中予以衣康酸或其普通机械遮盖衍生产品物体的冶疗益处,并感觉其意向靶点。介绍衣康酸的“前世姻缘”与“今世”,详情微信推文《乳酸的逆袭之表兄弟——衣康酸!这课带你去了解衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化装饰淀粉酶组学产品,实现1000+什么难以理解的度修饰语位点检测,保持稳定复现有趣靶点,全定位生信分享解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“感觉”到“核实”全程序流程服务质量,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验性标准流程

02、测试数据报告

03、经“点”逆转

在测评参数中,查出个资料中新闻稿件的经典英文靶点和衣康酸呈现位点,如弟一家被会发现的衣康酸共价呈现血清KEAP1,和糖酵解通道中的3个重点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,并且 炎性小体分为血清NLRP3和神经细胞损伤具体步骤中的重点血清RIPK3等,其质谱图以下图下图。

04、设备优势特点

1.强有力的加密管控质控

商业服务化活性聊天电极孵育、SDS-PAGE检查、WB安全验证、样品相关概述概述等甲乙双位子检查,确认的项目结局靠谱性。

2.高特点质谱器材公司

在Orbitrap Astral全第三代名将高辨认质谱仪火供下,保证衣康酸性反应淡化位点及球蛋白司法鉴定新程度,推助专业研究方案新找到。

3.全的流程一趟式安全服务

系统设计拜谱菌物不断完善的实验所游戏平台,可可以提供“组织教育培养→电极孵育→WB论文检测工具→深奥度衣康酸性反应绘制论文检测工具→炫舞心悦生信了解→独特位点PRM认可”全工艺流程服务管理,省时省事更省事。

05、解析资源(要素)

06、使用方问

PART 2、期刊论文安利

文献综述一

英文字母小标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

简体中文微信标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

调查游戏内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

文章二

英文版宝贝标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

常常标题格式:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

的研究文章:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、典例并衍生构思

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13包括很强的底物根据程度,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物制品衣康过酸突显组场地实测数据表格中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸掩盖(一下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结ppt

身为TCA循环法中的期间消化吸收物,衣康酸调低消化吸收、免疫力抗体系统和症状范围内的之间的功效,为控制免疫力抗体系统症状性症状出具了替代品控制方式。衣康酸空间结构特征中的亲电性α,β-不饱满羧酸空间结构特征能对球核苷酸上的抗逆性半胱氨酸残基实现烷基化绘制语(迈克尔加强反映),此种翻泽后绘制语被被视为“衣康酸绘制语(itaconation)”,因此应响球核苷酸功能模块,调节作用免疫力抗体系统回话和消化吸收路经,为多症状肿瘤药物技术创新出具新思绪。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用装饰淀粉酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学界完全按量靶向治疗新陈代谢组(QMT1000)或体力产生靶向药物产生组企业产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

符合论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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