
近日,东莞医科二本大学首先附设医疗王学浩院士评选微商团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向疗法电量消化吸收检测分析服务。
因为一级标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文翻译文章标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
老客户公司:南京医科大学
探讨材料:细胞
拜谱展示服务保障:转录组测序+蛋白质互作组+靶向药物卡路里排泄组
技能规划:
探索最终
01、YBX1被判定为HCC中糖酵解的最为关键的染色体
本探索抓取HCC恶性癌症样表(n=7)的单神经肿瘤细胞核RNA测序数值集实行分折,看到糖酵解几丁质酶主要是低效在恶性癌症神经肿瘤细胞核中,hdWGCNA分折识别系统出9个人类基因控制器(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的繁衍分折选择YBX1为自己繁衍的风险情况(图1H)。进一个步骤紧密联系IHC、WB测试和恶性癌症公司与挨近非恶性癌症公司的区域空间转录组学数值集表明YBX1是肝神经肿瘤细胞核癌开展的不确定靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被制定为调理HCC人体细胞糖酵解的关键所在条件
02、YBX1有利于HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗正能量产生组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1通过并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1紧密结合并催进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化加强其磷酸性反应,故而提高网站其核转位
进那步在线检测YBX1的O-GlcNAc糖基化是否有反应其磷过酸,在OGT敲低的HCC血细胞膜中或用OGT仰注射剂OSMI-1治理,YBX1球核蛋白酶品质更为明显减小,YBX1磷过酸更为明显下降(图4A-C)。IP工作彰显,在不同的Flag-YBX1底物品质下,YBX1-WT的磷过酸品质更为明显大于YBX1-T57A,反映磷过酸的提高这样不只是毕竟越高的YBX1球核蛋白酶表达爱方法(图4D)。分割了核和质酚类化合物发展TMG治理的HCC血细胞膜中YBX1核表达爱方法的上升(图4E-F),进那步发展YBX1磷过酸的最为关键的调节器细胞是AKT(图4G-I)。哪些发展提出O-GlcNAc糖基化根据使得其磷过酸来资料YBX1球核蛋白酶相对可靠性处理并使得核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖有效于其进三步發生磷酸性反应掩盖并都可以促进会其核转位
05、YBX1提高网站PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1有利于PKM2转录
06、YBX1 也能改善组核蛋白乳酸性反应遮盖平行
探究发觉YBX1敲低取得影响核脂肪酸乳硝化为用,需要是H3K18乳硝化为用(图6A-C)。糖酵解阻止剂2-DG的科学实验可确认了糖酵解与组核核蛋白乳硝化为用的进行有关,阻止糖酵解可取得影响H3K18la层次(图6D)。PKM2过传达可逆反应转YBX1敲低所导致的的H3K18la回落,以外源乳酸净化处理仅仅完善H3K18la,还引发YBX1传达上涨,显示具备领域评议(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR可确认,H3K18la使用含有于YBX1启动的子进行增进其转录,该步骤受O-GlcNAc糖基化干预(图6H-J),消息队列觉P300 上涨是YBX1增强学习H3K18乳酰化为用的机制化(图6K-L)。
图6.YBX1改善H3K18乳硝化作用绘制水平面
的文章个人总结
在这些理论研究中有关报道了YBX1在HCC中高抒发,如果与糖酵揭秘切有关于。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,而使稳定性血清质并扩大其抒发。种突显还提高YBX1在T57处的磷碱化,提高其核易位。之所以,这进程提升了糖酵解有关于染色体的转录并激刺乳酸的所产生。凡此种种,YBX1重置P300的转录,因而驱动器组血清的乳碱化,十分是H3K18la,H3K18乳碱化单向国家宏观调控YBX1染色体转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传病正负极馈环工作机制图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物技术为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向治疗卡路里分泌组技术服务,拜谱菌物建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、译员后装饰组学、代谢率组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
选取文章
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.